Vrhovni sud Federacije Bosne i Hercegovine odbio je, kao neosnovanu, žalbu Tužiteljstva Hercegovačko-neretvanske županije, kao i Obrane, te potvrdio presudu kojom se Ivan Zelenika osuđuje na tri godine zatvora zbog ratnog zločina počinjenog protiv civilnog stanovništva na području Mostara.
U presudi Županijskog suda u Mostaru iz listopada 2021. godine, navodi se kako je Ivan Zelenika za vrijeme rata i oružanog sukoba u Bosni i Hercegovini između Hrvatskog vijeća obrane (HVO) i Armije Republike Bosne i Hercegovine (ARBiH) od studenog 1993. do lipnja 1994. godine, u svojstvu pripadnika HVO-a, nečovječno postupao prema civilima bošnjačke nacionalnosti i nanosio im povrede tjelesnog integriteta.